La simulazione di combattimento definitiva, usata come copertura per il Progetto S3. Programma di addestramento studiato per riprodurre artificialmente Solid Snake, il più grande soldato della storia. Attraverso la ricostruzione dell’incidente di Shadow Moses e l’utilizzo di Solidus Snake e Olga, i Patriots sperano di trasformare Raiden nel soldato perfetto.
Tuttavia, la simulazione Solid Snake è solo una parte di un piano più grande e il Progetto S3 ha un obbiettivo ben diverso.
Raiden, scelto come modello di “persona qualunque”, viene posto nell’ambiente estremo dell’incidente di Shadow Moses, in condizioni simili a quelle affrontate da Solid Snake. La simulazione è studiata per dimostrare come GW possa creare, controllare e far confluire le emozioni, i pensieri e le azioni di Raiden, fornendo le basi per l’avvio del vero Progetto S3, la “Selezione per la Sanità Sociale”.